Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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