Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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IFT88Q13099 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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