Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms