Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms