Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms