Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX1P83916 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX1P83916 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX1P83916 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX1P83916 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX1P83916 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX1P83916 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX1P83916 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX1P83916 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX1P83916 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX1P83916 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX1P83916 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX1P83916 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX1P83916 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX1P83916 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX1P83916 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX1P83916 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms