Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms