Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms