Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms