Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME5P56597 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME5P56597 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms