Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF10P55107 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF10P55107 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF10P55107 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms