Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2A1P52655 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms