Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms