Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms