Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBRP36941 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LTBRP36941 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms