Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms