Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms