Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINB3P29508 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms