Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTX3P26022 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms