Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms