Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
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