Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms