Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms