Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBP07199 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBP07199 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBP07199 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms