Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOA4P06727 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOA4P06727 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOA4P06727 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOA4P06727 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOA4P06727 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA4P06727 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms