Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms