Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF2P04141 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF2P04141 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF2P04141 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF2P04141 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF2P04141 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF2P04141 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF2P04141 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF2P04141 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF2P04141 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF2P04141 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF2P04141 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF2P04141 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF2P04141 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF2P04141 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF2P04141 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF2P04141 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF2P04141 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF2P04141 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF2P04141 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF2P04141 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF2P04141 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF2P04141 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF2P04141 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF2P04141 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF2P04141 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF2P04141 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms