Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRATO95237 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRATO95237 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms