Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DENRO43583 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DENRO43583 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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