Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9YO00507 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
USP9YO00507 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9YO00507 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms