Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms