Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms