Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAPRE3Q9UPY8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms