Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms