Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms