Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PEMTQ9UBM1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms