Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC17A6Q9P2U8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms