Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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MIS18AQ9NYP9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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MIS18AQ9NYP9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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MIS18AQ9NYP9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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MIS18AQ9NYP9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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MIS18AQ9NYP9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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MIS18AQ9NYP9 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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MIS18AQ9NYP9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MIS18AQ9NYP9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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