Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms