Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYLDQ9NQC7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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