Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
C20orf27Q9GZN8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C20orf27Q9GZN8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms