Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms