Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
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