Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms