Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms