Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms