Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms