Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms