Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRACR2AQ9BSW2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms