Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms